עברו כבר 5 שנים מאז הכרנו לראשונה את דזמונד – צעיר בטלן עם חיים משעממים שמוצא את עצמו באמצע מאבק בין הטמפלרים למסדר המתנקשים. החשיבות של דזמונד נמצאת ב-DNA שלו, ובעזרת מכונה מיוחדת, ה-Animus, הוא יכול לחיות מחדש את החיים של אבות אבותיו המתנקשים. במשחק השלישי בסדרת Assassin’s Creed, דזמונד מכיר את Connor – מתנקש חצי אינדיאני וחצי אמריקני שחי בתקופת “מלחמת השחרור” האמריקאית. ל-Connor יש מידע הכרחי שיכול לעזור למסדר המתנקשים למנוע את סוף העולם בהווה.
את כל הרקע הזה נורא קל לשכוח ברגע שנכנסים למשחק – למי אכפת שסוף העולם מגיע כשיש כל כך הרבה לעשות באמריקה הישנה? בתור Connor אתם תנהלו חיים שלמים (שמתחילים עוד לפני שהוריו הכירו) הכוללים מגוון אלמנטים כמו ניהול עיר, ייצור ומסחר של ציוד קרב וחומרי גלם ואפילו ציד יצורים אגדיים כמו ביג פוט וקראקן.
את כל זה אתם עושים בתור מתנקש מקצועי עם מגוון רחב של כלים – מכלי הנשק האינדיאנים כמו הטומאהוק והקשת עד כלי נשק “מודרניים” כמו חרבות ואקדחים וכמובן הסכין הסמויה האיקונית שנותנת סטייל לכל התנקשות. חוץ מנשקים תמצאו גם כלי ציד, מגוון כלים “מנטרלים” כמו רעל ורימוני עשן, והרשימה עוד ארוכה. מדי פעם תשחקו גם את דזמונד בעולם ההווה, שמאז המשחקן הראשון הפך מלוזר רכרוכי למתנקש מקצועי בזכות ה”סינכרון” עם אבותיו. בכל רמה אפשרית, המשחק החדש מגוון הרבה יותר מקודמיו, זה מתחיל בערים הענקיות של אמריקה הישנה, ממשיך בשטחי בר ושטחי קרב עצומים ואפילו מאפשר לחקור מקדשים עתיקים וקסומים של תרבויות קדומות.